Originariamente parte di Villa Balbi, una dimora cinquecentesca appartenente prima alla famiglia Beccalla e poi passata ai Balbi, la cappella è sopravvissuta alla demolizione del complesso negli anni Trenta del Novecento, quando la villa venne abbattuta per far posto a nuove abitazioni. La cappella rimase protetta nel cuore della nuova area urbanizzata e per decenni è stata adibita ai più svariati usi. Nel tempo i suoi affreschi e pavimenti furono coperti e dimenticati, fino agli anni Ottanta quando tramite progressivi restauri sono stati riportati alla luce. Oggi la cappella appartiene alla Croce Bianca savonese, che l’ha recentemente riaperta al pubblico. Il FAI (Fondo Ambiente Italiano) tramite una petizione l’ha inserita nella lista dei “Luoghi del Cuore”, al fine di proteggerla e sostenerla.